メニューのデフォルトは ~/.fluxbox/menu ですが、 この設定は init ファイルで変更できます。例えば、
例 9.1. メニューファイルの設定
session.menuFile: ~/.fluxbox/menu
別のファイルを使いたいならただ ~/.fluxbox/menu を編集するだけでよいです。 しかしほとんどの人にとってはこのままでよいはずです。